单细胞表观遗传学领域的下一步发展

研究者们普遍认为，单细胞表观遗传学领域的下一步发展，是将多种研究方法的结合起来使用。在未来几个月或者几年里，我们将会看到能在单个细胞中同时检测转录组和表观基因组的技术。深入了解更多的单细胞信息，可以帮助人们理解不同细胞之间的差异，以及这些差异对发育或疾病状态所产生的影响。
分离单细胞
在进行单细胞表观遗传学分析之前，你需要先确定自己拿到了正确的细胞或细胞类型。
如果你想要的细胞已经处于悬浮状态（比如循环肿瘤细胞），而且含量相对比较丰富，那么流式细胞分析将是你的理想选择。如果你的样本是实体组织，那么可以用酶分解掉胶原和其他细胞外蛋白。不过酶学消化对细胞影响较大，甚至可能改变基因转录情况，Voet提醒道。在把组织细胞制成悬液之后，我们就可以通过特异性的荧光标签分离出自己想要的细胞。进一步深入单细胞是比较棘手的一步，可能需要用到微流体设备，尤其是在细胞量较少的时候。

将细胞分散到悬液中，会失去它们在组织里的位置信息。如果你想要了解单个细胞的邻居和环境线索，你就需要使用激光捕获显微切割技术。这种技术可以通过扫描组织切片，定位你想要研究的细胞，并将其提取出来。操作者需要非常小心，不要切到目的细胞流失含有RNA的细胞质，或者切掉部分细胞核，Voet指出。
数量最为稀少的细胞只能用毛细管等器具手动获取。分离到细胞之后，我们就可以进行表观遗传学分析了。现有技术一次只能进行一种类型的单细胞表观遗传学分析，你需要决定自己研究的是DNA、组蛋白还是染色质水平上的标签。